Không nhãn: Các nghiên cứu về proteomics định lượng không nhãn sử dụng phương pháp khối phổ lỏnglỏng để phân tích các peptide protein được tiêu hóa bằng enzym mà không cần nhãn đồng vị bền đắt tiền làm chuẩn nội, và chỉ cần phân tích dữ liệu khối phổ được tạo ra từ quá trình nhận dạng protein quy mô lớn và so sánh cường độ tín hiệu của các peptide tương ứng trong các mẫu khác nhau, để thực hiện định lượng tương đối các protein tương ứng với các peptide.

Có hai loại quy trình định lượng chính dựa vào việc phân tích thông tin phức tạp để hoàn tất quy trình định lượng: cường độ tín hiệu và phương pháp đếm phổ. Loại trước dựa trên cường độ đỉnh peptide liên quan đến khối phổ chính (cường độ đỉnh phổ khối), diện tích đỉnh (diện tích đỉnh), thời gian lưu sắc ký lỏng (thời gian lưu lC) và các thông tin khác để phân tích định lượng; sau này dựa trên khối phổ thứ cấp liên quan đến số lần peptide liên quan đến mỗi protein được xác định trên tổng số peptide (Peptide ẩn hoặc Số lượng phổ), hóa trị ion của peptide được xác định (số lượng lớn peptide được xác định) và thông tin khác.

1、Thống kê đầu ra dữ liệu

2、Kết quả xác định protein

3、Kết quả định lượng protein

4、Phân tích protein GO

5、Phân tích protein COG

6、Phân tích con đường chuyển hóa protein

7、Phân tích làm giàu protein GO khác biệt

8、Phân tích làm giàu đường dẫn của các protein khác biệt